Cy5.5 是一种发近红外（NIR）荧光的荧光染料 ，具有较高的荧光量子产率和较好的光稳定性。其激发波长在 675-694 纳米，发射波长在 700-720 纳米左右，能发出明亮的远红荧光。它的荧光信号强，组织穿透性好，自发荧光干扰低，在生物医学成像、生物标记、荧光染色等领域应用广泛。Cy5.5 可以通过化学反应与含有羧基、醛基、氨基等官能团的生物分子进行偶联，从而实现对生物分子的特异性标记，用于追踪和检测生物分子在细胞或组织中的分布、定位及动态变化。

光学性质

吸收光谱：最大吸收波长约为 675-680 nm，处于近红外区域。近红外光在生物组织中的穿透能力较强，且生物组织自身在该区域的自发荧光较弱，因此 Cy5.5 在生物成像等应用中具有明显优势。

发射光谱：最大发射波长约为 700-710 nm，同样位于近红外区域。发射的荧光信号具有较高的灵敏度和较低的背景干扰，适合用于高灵敏度的检测和成像。

荧光量子产率：具有较高的荧光量子产率，意味着它能够高效地将吸收的光能转化为荧光发射，从而提高检测的灵敏度和成像的质量。