Cy3 和 Cy5：

适用对象：

核酸：在核酸研究中，Cy3 和 Cy5 可以标记核酸探针，用于核酸杂交实验，检测特定基因的表达和定位。例如在基因芯片技术中，常用 Cy3 和 Cy5 标记的核酸探针来检测不同样本中基因的表达差异。

生物大分子相互作用：适用于研究生物大分子之间的相互作用，如蛋白质 - 蛋白质、蛋白质 - 核酸之间的相互作用。通过将其中一种生物大分子用 Cy3 或 Cy5 标记，利用荧光共振能量转移（FRET）技术研究它们之间的距离和相互作用的强弱。

图：Cy3、Cy5结构式

Bodipy 染料：

适用对象：

脂质：可用于标记细胞膜上的脂质分子，研究细胞膜的结构和功能，以及脂质分子在细胞内的运输和代谢过程。

酶活性：由于其对环境敏感的特性，可用于检测酶的活性。当酶与底物反应时，会引起周围环境的变化，从而影响 Bodipy 染料的荧光特性，通过检测荧光的变化可以间接反映酶的活性。

碘化丙啶（PI）：

适用对象：

细胞：常用于细胞周期分析和细胞Apoptosis 检测。PI 可以穿透细胞膜受损的细胞，与细胞内的核酸结合，发出红色荧光，而细胞膜完整的细胞则不能被 PI 染色。因此，通过 PI 染色可以区分活细胞和死细胞，以及分析细胞周期各阶段的细胞比例。

图：碘化丙啶结构式

DAPI（4',6-二脒基-2-苯基吲哚二盐酸盐）：

适用对象：

细胞核：是一种特异性的 DNA 染料，主要用于标记细胞核中的 DNA，观察细胞核的形态、结构和染色体的变化。在细胞遗传学研究中，DAPI 常用于染色体核型分析和染色体畸变检测。

图：DAPI结构式