蛋白质交联剂是一类具有两个或多个反应性末端的小分子化合物，其靶向特定的官能团（-NH2或COOH-THHS等），这些官能团可以分别与两个或更多分子偶联以将它们结合在一起。使用戊二醛作为蛋白质交联剂连接抗体和指示剂（如酶）具有形成随机交联基团的缺点，这很容易导致无序低聚物的形成。后来，选择了特定的交联剂，如NHS（用于NH2）和马来酰亚胺（用于dopHS），用于生命科学研究。熟练使用交联剂可以在多个领域研究蛋白质相互作用。目前，有一百多种常用的蛋白质交联剂。

交联剂实验中选择交联剂应考虑的因素：

1 反应特异性

交联剂应能特异性地与目标分子（如蛋白质、多肽等）的反应基团结合，避免非特异性结合导致的实验误差。

2 反应指向性

交联剂的反应指向性决定了它与哪些官能团发生反应。例如，有些交联剂主要指向氨基（-NH2）或羧基（-COOH），而有些则可能指向硫醇基（-SH）等。了解目标分子的官能团类型，有助于选择合适的交联剂。

3 间臂长度性

间臂长度（间隔臂长度）是两个反应基团之间的距离，它决定了偶联物的柔韧性。较长的间臂可以提供更大的灵活性，但也可能增加非特异性结合的风险。因此，在选择交联剂时，应根据实验需求平衡间臂长度。

4 水溶性

水溶性交联剂易于在水溶液中分散，有利于与目标分子充分接触并发生反应。对于在水溶液中进行的实验，应选择水溶性较好的交联剂。

5 透膜性

如果实验需要在细胞或组织内部进行交联，那么交联剂的透膜性就成为一个关键因素。具有透膜能力的交联剂能够穿过细胞膜，进入细胞内部进行交联反应。

6 反应基团数量

交联剂可以含有一个或多个反应基团。具有多个反应基团的交联剂能够同时与多个目标分子结合，形成更复杂的交联网络。根据实验需求选择合适的反应基团数量。

7 热反应还是光电反应

有些交联剂需要热激活才能与目标分子发生反应，而有些则可以通过光电效应触发反应。选择哪种类型的交联剂取决于实验条件和目标分子的性质。

8 可否切断

对于某些应用，如质谱分析，可能需要使用可切断的交联剂。这些交联剂在特定条件下（如pH值、温度、光照等）可以断裂，从而释放出交联前的分子片段，便于后续分析。

9 可否碘标

碘标记是一种常用的放射性标记方法，可用于追踪和检测生物分子在体内的分布和代谢。如果实验需要进行碘标记，那么应选择含有可碘化基团的交联剂，或者通过化学方法将碘标记引入交联剂中。然而，需要注意的是，碘标记可能涉及放射性物质的使用和处理，因此需要严格遵守相关安全规定。